1、工資開支來源：正式編制人員工資由財政撥款解決；合同制人員工資由單位預算外收入中解決。
2、福利待遇：正式編制人員的福利待遇按政策規(guī)定及上級部門規(guī)定執(zhí)行；合同制人員參照正式編人員標準執(zhí)行，但實際上低很多或缺項。
3、正式編人員可以在事業(yè)單位之間調動；合同制人員不能。
4、正式編制人員可以提任副科級職務；合同制人員不可以。事業(yè)單位聘任制干部是沒有編制的，類似于合同制職工，但福利待遇肯定是按照事業(yè)單位的，如果是公務員單位里的聘任制，如法院的聘任制書記員職位，那是按照公務員的待遇。
5、合同制人員隨時會被辭退；正式編制人員如無錯誤必須要工作滿合同年限才能辭退。正式編制人員一般一簽就是3到5年的工作時間。
6、正式編制人員需要每年去人事局繳納人事代理費用；合同制人員不用。
事業(yè)單位聘用制是指事業(yè)單位直接和工作人員簽訂聘用合同，來確定雙方聘用關系，明確雙方權利、責任、義務的一種人事管理制度。
臨時工就是事業(yè)單位中沒有在編制內人員，這些職工大多是通過勞務派遣的方式，來簽訂勞動合同的。
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